Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms