Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms