Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbr1Q9JIT0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms