Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms