Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb1Q9JIF7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copb1Q9JIF7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms