Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms