Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3bQ9JHJ5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr3bQ9JHJ5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms