Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms