Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp29Q9ES63 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Usp29Q9ES63 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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