Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms