Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Erg28Q9ERY9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Erg28Q9ERY9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms