Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrnb2Q9ERK7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms