Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lima1Q9ERG0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms