Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms