Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms