Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SyncQ9EPM5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms