Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa8Q9DCJ5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms