Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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