Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Csnk1dQ9DC28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1dQ9DC28 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnk1dQ9DC28 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1dQ9DC28 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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