Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms