Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc97Q9DBT3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms