Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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