Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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