Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn3Q9DAW9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms