Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms