Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhc1Q9D9T8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efhc1Q9D9T8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms