Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx5Q9D8U8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms