Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms