Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms