Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp2c55Q9D816 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2c55Q9D816 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms