Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms