Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa5Q9D7I0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms