Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn23Q9D7D7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms