Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl40Q9D783 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl40Q9D783 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms