Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D727 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D727 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D727 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9D727 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D727 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms