Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc52a3Q9D6X5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms