Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Borcs6Q9D6W8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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Borcs6Q9D6W8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Borcs6Q9D6W8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Borcs6Q9D6W8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Borcs6Q9D6W8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Borcs6Q9D6W8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms