Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lpcat2bQ9D5U0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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