Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms