Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930449I24RikQ9D5E3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms