Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms