Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms