Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lonrf3Q9D4H7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms