Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam90a1bQ9D4F3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms