Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem30cQ9D4D7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms