Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Iqcf3Q9D498 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms