Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2lQ9D478 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2lQ9D478 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms