Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms