Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms