Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms